第21話「ピラミッド炎上！」トトは現れた黒城をデュエルで排除しようと戦いを始める。お互いに譲らぬデュエルを繰り広げていく中、勝舞たちはカプセルに入れられたDrルートを見つけ出すことに成功する。そのまま脱出しようとした勝舞たちだったが、その時異変が!?
第22話「告白」Drルートを救い出した勝舞たち。記憶が戻ったルートから聞かされる記憶喪失の真実。ヤエサル様からデュエル・マスターの証を守るように言われたルートが最終手段として敵に見つからないようにあえて記憶喪失になるように仕向けたのだった。そんな中、またしてもザキラの手下、イエスマンとキサナデゥが現れる！