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千年パズルを完成させたことにより、≪闇遊戯≫という、もう1人の人格を呼び覚ました武藤遊戯。海馬コーポレーションの社長にして決闘者(デュエリスト)の頂点に君臨する海馬瀬人や、仲間たちと数々の死闘を繰り広げたが、過去との因縁により、もう1人の自分との闘いを余儀なくされ、遊戯と闇遊戯はついに決別し、別々の道へ旅立つこととなった――。そうして、闇遊戯との最後の決闘を終えて、日常を取り戻したかに見えた遊戯たち。その前に現れた謎の少年≪藍神(あいがみ)≫。そして、世界中で次々と起こる謎の失踪事件。ただひたすら千年パズルを探し求める海馬。すべてのピースが合わさるとき、再び決闘（デュエル）の幕が切って落とされる！
ファンの声(3件)
旧作ファン向け
現存のOCGプレイヤーどう思うか知らんけどWJで読んでた旧作ファン向けの作品
話の流れはWJの後日談なので新規勢バイバイなシンクロもエクシーズも無い世界だからこそ
琴線に触れるのは旧作ファン向けだと思います。
観てると涙腺が緩くなるのは加齢故かはわかりませんが
WJ見てなくてもぐっとくるつくりをしてる映画だと思いました
再会の喜び。
遊戯たちが、また見れる。
遊戯たちに、また会える。
遊戯王ファンにとって、これほど嬉しいことはありません。
でも、それは彼らも一緒なのでしょう。
アテムと語り合えた遊戯も。
別れを認めずに意地で次元を超えた海馬も。
海馬を目の前にしたアテムも。
みんな、友との再会を噛みしめているに違いありません。
原作の続き
この作品は原作漫画の続きの為ペガサスが死亡していたり闘いの儀で海馬が見届けていなかったりとアニメ版とは少し違いますもちろんここからGXに繋がることもありません
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