デススティンガーの攻撃により、廃墟と化した共和国首都・ニューへリックシティ。デススティンガーは再びマグマへと潜って行く。ウインディーヌレイクに避難したルイーズ大統領。そこでは共和国の最終兵器、ウルトラザウルスが隠されていた。ウルトラザウルスには独立した7つのコアが存在し、その全てが正常に機能した時に覚醒するというものだった。だが、現在は、1つが仮死状態にあるという。勝利への不安が消えないまま、デススティンガー襲撃の情報が入る。デススティンガーが到着するまで3時間。ゾイドコア復旧までは2時間。安心するのもつかの間、デススティンガーが周囲の山々を攻撃し始める。ヒルツは全ての障害物を排除し、直接バン達を狙うつもりなのだ！デススティンガーの襲撃にウルトラザウルスは間に合わない。何とか対応策に乗り出すバン達。果たしてウルトラザウルスは覚醒するのか…!?