この宇宙を凍えさせるもの──
「ウラリアの魔女」との対決の刻が迫る。
“魔女” の正体── 暗黒の宇宙に潜む中間補給基地ディガブラス。
デザリアムと「ウラリアの魔女」との関係とはなにか？
“冷えた宇宙” という絶対的劣勢のなか、波動砲すら無効化する巨大要塞に、ヤマトとガルマン・ガミラスの連合艦隊は苦戦を強いられる。

そのさなか、再び古代の前に姿を現すアルフォン。
雪という縁に導かれながらも、異なる未来を信じ、相容れぬふたりが目撃する、ディガブラスの真実とは──！？

一方、マザー・デザリアムの術中に陥った地球では、人々が自らの意思で “デザリアム化” を受け入れつつある。もはや、一刻の猶予もない。

すべての謎の答えを求めて──
未知なる空間に飛び込んだヤマトを、衝撃の結末が待ち受ける！！